MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Escherichia coli O7:K1 str. CE10 plasmid pCE10C

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017649	T	6	6	2054	2059	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
2	NC_017649	ATA	2	6	2134	2139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622391
3	NC_017649	TAAA	2	8	2282	2289	75 %	25 %	0 %	0 %	386622391
4	NC_017649	GCT	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386622391
5	NC_017649	TATT	2	8	2371	2378	25 %	75 %	0 %	0 %	386622391
6	NC_017649	TTGTTT	2	12	2411	2422	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386622391
7	NC_017649	TTA	2	6	2470	2475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
8	NC_017649	CT	3	6	2496	2501	0 %	50 %	0 %	50 %	386622391
9	NC_017649	AATTC	2	10	2555	2564	40 %	40 %	0 %	20 %	386622391
10	NC_017649	GT	3	6	2570	2575	0 %	50 %	50 %	0 %	386622391
11	NC_017649	T	6	6	2575	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
12	NC_017649	ATT	2	6	2581	2586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
13	NC_017649	T	6	6	2620	2625	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
14	NC_017649	A	6	6	2638	2643	100 %	0 %	0 %	0 %	386622391
15	NC_017649	T	8	8	2652	2659	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
16	NC_017649	TAT	2	6	2664	2669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622391
17	NC_017649	A	6	6	2682	2687	100 %	0 %	0 %	0 %	386622391
18	NC_017649	T	6	6	2715	2720	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
19	NC_017649	GA	3	6	2732	2737	50 %	0 %	50 %	0 %	386622391
20	NC_017649	A	6	6	2876	2881	100 %	0 %	0 %	0 %	386622391
21	NC_017649	TGA	2	6	2902	2907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622391
22	NC_017649	AAAT	2	8	2937	2944	75 %	25 %	0 %	0 %	386622391
23	NC_017649	GTT	2	6	2970	2975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622391
24	NC_017649	GGT	2	6	2983	2988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386622391
25	NC_017649	GT	3	6	2987	2992	0 %	50 %	50 %	0 %	386622391
26	NC_017649	TCT	2	6	3054	3059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386622391
27	NC_017649	T	6	6	3134	3139	0 %	100 %	0 %	0 %	386622391
28	NC_017649	TTG	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622391
29	NC_017649	CATG	2	8	3168	3175	25 %	25 %	25 %	25 %	386622391
30	NC_017649	A	6	6	3244	3249	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
31	NC_017649	T	6	6	3274	3279	0 %	100 %	0 %	0 %	386622392
32	NC_017649	AG	3	6	3324	3329	50 %	0 %	50 %	0 %	386622392
33	NC_017649	TTA	2	6	3341	3346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392
34	NC_017649	A	7	7	3395	3401	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
35	NC_017649	ATT	2	6	3407	3412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392
36	NC_017649	T	6	6	3411	3416	0 %	100 %	0 %	0 %	386622392
37	NC_017649	AAT	2	6	3418	3423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
38	NC_017649	AT	3	6	3432	3437	50 %	50 %	0 %	0 %	386622392
39	NC_017649	A	6	6	3450	3455	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
40	NC_017649	CAA	2	6	3494	3499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622392
41	NC_017649	TGA	2	6	3519	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
42	NC_017649	AGAA	2	8	3525	3532	75 %	0 %	25 %	0 %	386622392
43	NC_017649	ATG	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
44	NC_017649	AC	3	6	3586	3591	50 %	0 %	0 %	50 %	386622392
45	NC_017649	AT	3	6	3592	3597	50 %	50 %	0 %	0 %	386622392
46	NC_017649	GCAGG	2	10	3632	3641	20 %	0 %	60 %	20 %	386622392
47	NC_017649	ATG	2	6	3673	3678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
48	NC_017649	T	6	6	3724	3729	0 %	100 %	0 %	0 %	386622392
49	NC_017649	A	7	7	3731	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	386622392
50	NC_017649	AAC	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386622392
51	NC_017649	AAG	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386622392
52	NC_017649	GAT	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386622392
53	NC_017649	GAG	2	6	3922	3927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386622392
54	NC_017649	AATA	2	8	3930	3937	75 %	25 %	0 %	0 %	386622392
55	NC_017649	ACG	2	6	3967	3972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386622392
56	NC_017649	ATA	3	9	4001	4009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
57	NC_017649	TCAG	2	8	4035	4042	25 %	25 %	25 %	25 %	386622392
58	NC_017649	AAT	2	6	4066	4071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386622392
59	NC_017649	TGT	2	6	4152	4157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386622392
60	NC_017649	ATT	2	6	4160	4165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386622392

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.